清康乾年间被称为盛世，素来盛世兴文，在乾隆三十七年（1772年）十一月，安徽学政朱筠上奏《永乐大典》的辑佚问题的奏本，得到乾隆皇帝爱新觉罗﹒弘历的认可，乾隆皇帝即诏令全国将所辑佚书与“各省所采及武英殿所有官刻诸书”汇编在一起，取名为《四库全书》。在乾隆皇帝的主持下，由纪晓岚等360多位高官、学者编纂，3800多人抄写，费时13年编成。丛书分经、史、子、集四部，故名“四库”；共有3500多种书，7.9万卷，3.6万册，约8亿字，基本上囊括了中国古代所有图书，故称“全书”。接着，乾隆皇帝又命人手抄了7部《四库全书》，下令分别藏于全国多地。其中先抄好的4部分别贮于紫禁城文渊阁、圆明园文源阁、河北承德文津阁、辽宁沈阳文溯阁珍藏，这就是所谓的“北四阁”；后抄好的3部分贮于扬州文汇阁、镇江文宗阁、杭州文澜阁珍藏，这就是所谓的“南三阁”。

《四库全书》从完成至今的200多年建、间，可以说饱尽沧桑，多份抄本在战火中被毁。

文源阁本在1860年英法联军攻占北京，火烧圆明园时被焚毁；

文宗、文汇阁本，则在太平天国运动期间被毁；

辽宁文溯阁《四库全书》1922年险些被日本人骗走，（1914年袁世凯为炫耀文治武功，下令将文溯阁本运到北京。1924年张学良将军交涉，文溯阁《四库全书》回归故里。）1966年又因中苏关系紧张怕发生战争，经林彪批准从沈阳搬到兰州，现藏甘肃省《四库全书》馆；

文津阁则于新中国成立初期调拨到国家图书馆，这是唯一一套原书函原架保存的珍贵版本。

杭州文澜阁藏书楼1861年因太平军第二次攻占杭州时坍塌，所藏《四库全书》散落民间，后由浙江藏书家丁丙与其兄丁申收拾、整理、补抄，才抢救回原书的四分之一。文澜阁本在民国时期又经二次补抄。1914年在杭州图书馆第一任馆长钱恂的支持下，由徐锡麟二弟徐仲荪及其学生堵福诜自费补抄，历时7年，史称“乙卯补抄”。现藏于浙江图书馆，为浙江图书馆的“镇馆之宝”，价值连城。

保存较为完好的文渊阁本原藏北京故宫，解放前经上海、南京运转至台湾，现藏台北故宫博物院。

清代著名学者阮元巡抚浙江时，留心搜访《四库全书》未收之书，先后求得175种，依《四库全书总目》例，为每书撰写提要、随书奏进。嘉庆帝十分高兴，遂据传说夏禹登宛委山得金简玉宗之书，亲笔赐名《宛委别藏》。还在每部书的首页加盖了“嘉庆御览之宝”的御玺，又命工匠制作了100个楠木书匣，加以精心包装，然后陈列在养心殿御书案背后的书架上。《宛委别藏》系嘉庆帝在故宫养心殿的藏书总称。

直到20世纪30年代商务印书馆才选了40种影印出版,名为《选印宛委别藏》；至80年代台湾商务始将原书重行整理，影印出版，但所收书仅得161种，其余12种不知去向。

1936年秋，蔡元培（1868-1940），中国教育家。将故宫博物院送给他的《宛委别藏》一百五十册，转赠给庐山图书馆，这些古籍现在庐山图书馆保存完好。

凉州区图书馆所藏《四库全书》，是台北故宫博物院所藏文渊阁本《四库全书》的1987版缩印影印本。由原武威市人民政府于1987年拨专款人民币4.5万元,购进台湾文渊阁《四库全书》影印本一套，计1500册，相继又购进《宛委别藏》120册。

目前，在县级图书馆收藏的《四库全书》十分罕见。文渊阁本《四库全书》原尺寸影印本发行全套共36375册，市场售价高达4860万元。